网络理论是21世纪最令人兴奋和最具活力的科学领域之一。 网络无处不在, 从提供我们的身体动力的代谢产物到社交网络, 都塑造着我们的生活。 本模块旨在介绍网络背后的理论, 我们将图论作为语言的基础。 了解网络拓扑结构,还将继续了解不同的网络属性和模型, 我们谈论无标度网络,令人惊讶的小型语音现象 和生物网络。 这些本质上都是数学, 还将在提示中看到,这里回忆起的所有概念都出现在现实生活中。 此外,本模块中介绍的符号将使我们能够以一致的方式 讨论整个课程中遇到的各种网络。 用于建模网络的基本数学概念是图。那么让我们看看,图是什么? 看这张图片。 看到了什么? 通过一组点来连接它们,它们是图。 图代表离散数学的关键概念,形式上这些点称为图顶点或网络节点, 它们之间的链接称为边。 因此,图G被定义为由V或 V(G) 表示的一组顶点, 以及由E或 E(G) 表示的边集。 图形易于从图片中绘制和理解, 易于通过计算机程序处理。 如果两个顶点由边连接,则称为相邻或邻居。 顶点u和v之间的边由{u,v}或短uv表示。 因此,可以通过列出顶点和边来描述图形,如此处所写,或者使用漂亮的图片。 你更喜欢哪一个? 边缘是一对。 有向边是有序对。 它表示为(v1,v2),而无向边是没有方向的无序对 表示为{v1,v2}。 更多术语。 n个顶点是相同顶点的图的边缘称为环。 如果该顶点是其末端之一,则边缘与顶点一起入射。 那么让我们看看图G1。 v2和v3是相邻。 e2与v2一起,e6是环。 我们遇到的图形或网络可以根据它们的边缘样式分为两大类: 有向图和无向图。 无向图由一组非空的顶点组成,由V和E表示,一组无向边。 有向图是一组顶点V和一组有向边。 例如,G1是无向图,而G2是有向图。在生物学, 转录调控网络和代谢网络通常是更放松的有向图。 例如,在转录调控网络节点中 代表具有表示它们之间相互作用的边缘的基因, 这将是有向图,因为如果基因A调节基因B,则存在自然方向 与从A开始并在B结束的相应节点之间的边缘相关联。 而蛋白质交互网络通常被建模为无向图, 其中节点代表蛋白质和边缘代表互动。 稍后在本单元和其他模块中,我们将更多地讨论这些网络及其属性。 通过描述性名称引用一些基本特殊图是一种习惯。 我们将回顾最着名的一些。 第一个是循环图。 长度为n的循环图是图, n个顶点以n个边缘以循环方式连接。 顶点数应该多于三个。 由Cn表示的环,其中n是顶点的数量,或者它们可以是边数,因为它们是相等的。 下一个是图形路径。 长度n的路径看起来像一条中间有结的线。 它有n + 1个顶点连接,因此有n个边。 正如其名称所示,下一个是n个顶点上的完整图形 所有对形成边缘。 节点数应该多于一个称为完整图。 二分图是具有两个部分的图形,边缘将节点从一个部分连接到另一个部分。 完全的二分图 C(m,n) 在两个部分中有m + n个顶点,并且边的连接 来自不同部分的所有 m,n 对。最后两个图形类是轮子和n个立方体。 Wn表示将新的单个顶点连接到环Cn的所有顶点而形成的图。 我们看到的最后一种图是n立方体或超立方体。 它由Qn显示,是一个图形,其顶点是 2^n 二进制字符串, 当且仅当字符串恰好在一个坐标中不同时,两个顶点相邻。 图G中的顶点V的程度是G之间入射的边的数量。 如果图的所有顶点具有相同的度数d,则该图是d-正则的。 对于有向图, 我们可以改进我们的定义并将其分为两个:度数和出度。 在度数中,v是终点顶点的边数, 出度是v为初始顶点的边数。 如果以自然数序列写出图的顶点度数 然后我们度序列或图的分数。 在抽象图中,它们的顶点通常没有名称,所以我们必须以某种方式对它们的度序进行排序。 特定顺序并不重要。 如果知道图的度序列,那么您可以对图中的边数进行说明吗? 可以证明,简单无向图中的边数是其度序列之和的两倍。 握手定理可用于确定给定序列是否是图。 为什么序列1 2 3 4不能是图的度序列? 是的,总和不是偶数,因此是不可能的。